Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MAPRE3Q9UPY8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAPRE3Q9UPY8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms