Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TNFSF18Q9UNG2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms