Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms