Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms