Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SEMA3CQ99985 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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