Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms