Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD1Q6UXZ0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms