Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms