Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms