Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFKFB3Q16875 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms