Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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