Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP4Q15650 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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