Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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HNF4GQ14541 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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HNF4GQ14541 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HNF4GQ14541 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HNF4GQ14541 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HNF4GQ14541 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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HNF4GQ14541 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HNF4GQ14541 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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