Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms