Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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BNIP1Q12981 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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BNIP1Q12981 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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BNIP1Q12981 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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