Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYP4F3Q08477 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYP4F3Q08477 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms