Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPL23P62829 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPL23P62829 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms