Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BACE1P56817 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BACE1P56817 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BACE1P56817 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BACE1P56817 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BACE1P56817 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BACE1P56817 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BACE1P56817 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BACE1P56817 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms