Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA13P31271 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms