Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSFA2P28290 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms