Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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