Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms