Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms