Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USH1CQ9Y6N9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USH1CQ9Y6N9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms