Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX8Q9Y5X2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX8Q9Y5X2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms