Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAI2Q9Y5P3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms