Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms