Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRP12Q9Y561 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRP12Q9Y561 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRP12Q9Y561 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms