Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HECTD4Q9Y4D8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HECTD4Q9Y4D8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HECTD4Q9Y4D8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HECTD4Q9Y4D8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms