Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED5Q9Y3A6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms