Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH1Q9Y2L9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRCH1Q9Y2L9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRCH1Q9Y2L9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.4 ms