Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHOC2Q9UQ13 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHOC2Q9UQ13 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHOC2Q9UQ13 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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