Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGTPBP1Q9UPW5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGTPBP1Q9UPW5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms