Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNRC6BQ9UPQ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNRC6BQ9UPQ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNRC6BQ9UPQ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNRC6BQ9UPQ9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms