Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARX2Q9UMQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARX2Q9UMQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BARX2Q9UMQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms