Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH3Q9ULD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNH3Q9ULD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms