Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GGA1Q9UJY5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA1Q9UJY5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGA1Q9UJY5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GGA1Q9UJY5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms