Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL4Q9UJQ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL4Q9UJQ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SALL4Q9UJQ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms