Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIMS3Q9UJD0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIMS3Q9UJD0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIMS3Q9UJD0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms