Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX20Q9UHI6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDX20Q9UHI6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX20Q9UHI6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms