Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC3BQ9UH17 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOBEC3BQ9UH17 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms