Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEPT3Q9UH03 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEPT3Q9UH03 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEPT3Q9UH03 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms