Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNAL1Q9UBT7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNAL1Q9UBT7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNAL1Q9UBT7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNAL1Q9UBT7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms