Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPARGC1AQ9UBK2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPARGC1AQ9UBK2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms