Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCOR3Q9P2K3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCOR3Q9P2K3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCOR3Q9P2K3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms