Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARCH4Q9P2E8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH4Q9P2E8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms