Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms