Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTR3BQ9P1U1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms