Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNRD1Q9P1U0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNRD1Q9P1U0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRD1Q9P1U0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRD1Q9P1U0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRD1Q9P1U0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRD1Q9P1U0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRD1Q9P1U0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRD1Q9P1U0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms