Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD3Q9NZN3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD3Q9NZN3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD3Q9NZN3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms